В материалах дела говорится, что Филатов возглавлял «Сиваш» – межрегиональное отделение «иеговистов» (организация, запрещённая в РФ).
Ещё летом 2017 года главное управление Минюста РФ по Крыму и Севастополю уведомило Филатова, что «Свидетели Иеговы» (организация, запрещённая в РФ) запрещены в России и признаны экстремистской организацией, но «Филатов продолжил свою деятельность». Согласно постановлению о возбуждении уголовного дела, он проводил у себя дома собрания, религиозные выступления и пропагандировал религиозные идеи «Свидетелей Иеговы» (организация, запрещённая в РФ). В качестве доказательства силовики представили аудиозапись, на которой верующие обсуждают библейские стихи и поют христианские песнопения.
В итоге отца четырёх детей обвинили в подрыве «основ конституционного строя и безопасности государства» из-за совместного чтения Библии в кругу семьи и друзей в собственном доме. Как отмечает защита подсудимого, несколько раз свидетели со стороны обвинения меняли показания по делу, а один из свидетелей дал ложные показания. При этом суд откровенно игнорировал все доводы и требования адвокатов.
Помимо лишения свободы суд также запретил Филатову заниматься просветительской деятельностью, выступать, публиковаться в СМИ и интернете сроком на пять лет и с ограничением свободы сроком на один год.